| 地區 | 姓名 | 號次 | 得票數 | 得票率 |
| 宜蘭縣 | 馬英九 | 02 | 115496 | 44.89% |
| 桃園縣 | 馬英九 | 02 | 639151 | 57.2% |
| 新竹縣 | 馬英九 | 02 | 190797 | 65.76% |
| 苗栗縣 | 馬英九 | 02 | 206200 | 63.85% |
| 彰化縣 | 馬英九 | 02 | 369968 | 50.58% |
| 南投縣 | 馬英九 | 02 | 158703 | 54.63% |
| 雲林縣 | 馬英九 | 02 | 159891 | 41.67% |
| 嘉義縣 | 馬英九 | 02 | 120946 | 39.04% |
| 屏東縣 | 馬英九 | 02 | 211571 | 42.93% |
| 臺東縣 | 馬英九 | 02 | 72823 | 66.47% |
| 花蓮縣 | 馬英九 | 02 | 118815 | 70.3% |
| 澎湖縣 | 馬英九 | 02 | 22579 | 49.76% |
| 基隆市 | 馬英九 | 02 | 128294 | 59.29% |
| 新竹市 | 馬英九 | 02 | 134728 | 57.43% |
| 嘉義市 | 馬英九 | 02 | 69535 | 46.27% |
| 金門縣 | 馬英九 | 02 | 34676 | 89.24% |
| 連江縣 | 馬英九 | 02 | 4507 | 86.61% |
| 臺北市 | 馬英九 | 02 | 928717 | 57.87% |
| 高雄市 | 馬英九 | 02 | 730461 | 44.19% |
| 新北市 | 馬英九 | 02 | 1245673 | 53.73% |
| 臺中市 | 馬英九 | 02 | 792334 | 52.16% |
| 臺南市 | 馬英九 | 02 | 435274 | 39.8% |